Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms