Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms