Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC97Q96F63 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms