Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHFRQ96EP1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms