Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC126Q96EE4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC126Q96EE4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms