Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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RPUSD4Q96CM3 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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