Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms