Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ04

LRTOMT, Transmembrane O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTOMTQ8WZ04 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRTOMTQ8WZ04 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms