Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
COPS9Q8WXC6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms