Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC12Q8WUD4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms