Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TTC21AQ8NDW8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TTC21AQ8NDW8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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TTC21AQ8NDW8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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TTC21AQ8NDW8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TTC21AQ8NDW8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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