Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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ZNF248Q8NDW4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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ZNF248Q8NDW4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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ZNF248Q8NDW4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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ZNF248Q8NDW4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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