Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms