Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL3Q8N8U3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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