Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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TMCO5AQ8N6Q1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMCO5AQ8N6Q1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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TMCO5AQ8N6Q1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TMCO5AQ8N6Q1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TMCO5AQ8N6Q1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TMCO5AQ8N6Q1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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