Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD35Q8N283 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms