Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD2Q8IZ73 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms