Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VITQ6UXI7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms