Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VSTM1Q6UX27 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VSTM1Q6UX27 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms