Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms