Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 SLC39A14-203ENST00000359741 4641 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 CLINT1-206ENST00000523094 3987 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 RAVER1-201ENST00000293677 3595 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
OBSCNQ5VST9 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
OBSCNQ5VST9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms