Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms