Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms