Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms