Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMER1Q5JTC6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms