Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA8Q53HL2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA8Q53HL2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms