Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms