Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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GEN1Q17RS7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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GEN1Q17RS7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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GEN1Q17RS7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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GEN1Q17RS7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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GEN1Q17RS7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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GEN1Q17RS7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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GEN1Q17RS7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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GEN1Q17RS7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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GEN1Q17RS7 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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GEN1Q17RS7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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GEN1Q17RS7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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