Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CA9Q16790 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CA9Q16790 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CA9Q16790 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms