Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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