Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms