Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CTF1Q16619 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CTF1Q16619 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CTF1Q16619 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CTF1Q16619 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CTF1Q16619 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CTF1Q16619 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CTF1Q16619 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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