Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms