Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms