Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.2 ms