Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms