Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CLCA4Q14CN2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CLCA4Q14CN2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CLCA4Q14CN2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CLCA4Q14CN2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CLCA4Q14CN2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CLCA4Q14CN2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CLCA4Q14CN2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CLCA4Q14CN2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CLCA4Q14CN2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CLCA4Q14CN2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLCA4Q14CN2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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