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| FOXE3 | Q13461 | MBNL1-201 | ENST00000282486 | 6422 nt | APPRIS P4 TSL 5 BASIC | 12.91 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC026412.1-202 | ENST00000512335 | 2231 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.91 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AURKAIP1-201 | ENST00000321751 | 798 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 12.91 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | BLOC1S2-202 | ENST00000370372 | 1249 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.91 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | C1QC-202 | ENST00000374639 | 1183 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 12.91 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MAPK15-202 | ENST00000395107 | 834 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.91 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CBR1-202 | ENST00000399191 | 838 nt | TSL 3 BASIC | 12.91 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SS18L2-202 | ENST00000447630 | 1047 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 12.91 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ITPA-203 | ENST00000455664 | 729 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.91 | □□□□□ -0.34 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC069335.1-201 | ENST00000489972 | 472 nt | BASIC | 12.91 | □□□□□ -0.34 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC025678.2-201 | ENST00000562061 | 970 nt | BASIC | 12.91 | □□□□□ -0.34 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC244153.1-202 | ENST00000617855 | 482 nt | TSL 3 BASIC | 12.91 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC084121.4-201 | ENST00000641598 | 221 nt | BASIC | 12.91 | □□□□□ -0.34 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | FGFR2-207 | ENST00000359354 | 1680 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.91 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SH2D2A-202 | ENST00000368199 | 1658 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.91 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | POLR3E-202 | ENST00000359210 | 2469 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.91 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MYCL-203 | ENST00000397332 | 3256 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.91 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | OSR2-209 | ENST00000522510 | 1528 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 12.91 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL139398.1-201 | ENST00000638795 | 1529 nt | TSL 5 BASIC | 12.91 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RBM4-204 | ENST00000408993 | 1763 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 12.91 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | GPR158-AS1-201 | ENST00000449643 | 2433 nt | TSL 2 BASIC | 12.91 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RGS7-203 | ENST00000366564 | 2295 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.91 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL512625.3-203 | ENST00000445604 | 1602 nt | TSL 5 BASIC | 12.91 | □□□□□ -0.34 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | GMPR2-217 | ENST00000559104 | 1719 nt | TSL 5 BASIC | 12.91 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZNF764-201 | ENST00000252797 | 2738 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ARNTL2-208 | ENST00000544915 | 6785 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | FGFR3-208 | ENST00000481110 | 4217 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SFRP1-201 | ENST00000220772 | 4492 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | SELENOF-208 | ENST00000616787 | 1835 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | CA10-203 | ENST00000451037 | 3189 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZMIZ1-205 | ENST00000611351 | 2196 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | OS9-205 | ENST00000413095 | 1660 nt | TSL 2 BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | MGEA5-201 | ENST00000357797 | 3263 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | BNC1-201 | ENST00000345382 | 4610 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | VPS54-201 | ENST00000272322 | 3463 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZNF805-201 | ENST00000354309 | 2396 nt | TSL 5 BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RWDD3-201 | ENST00000263893 | 1078 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | YIF1B-201 | ENST00000329420 | 964 nt | TSL 3 BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | TSSC4-202 | ENST00000380992 | 992 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | SAPCD1-209 | ENST00000425424 | 820 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC004449.1-201 | ENST00000564240 | 433 nt | BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | TMEM114-205 | ENST00000624696 | 560 nt | TSL 2 BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SLC27A1-201 | ENST00000252595 | 3594 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | INPP4A-202 | ENST00000409016 | 9996 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TRPV4-207 | ENST00000541794 | 2475 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SLC2A13-202 | ENST00000380858 | 3082 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | BCAS3-204 | ENST00000585744 | 2203 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PRAG1-202 | ENST00000622241 | 4639 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SLC17A9-201 | ENST00000370349 | 2594 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | YAP1-211 | ENST00000629586 | 1365 nt | TSL 5 BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC104809.1-201 | ENST00000425110 | 2345 nt | TSL 2 BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ACIN1-205 | ENST00000457657 | 4815 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | FAM76B-201 | ENST00000358780 | 3952 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PABPC4-201 | ENST00000372856 | 3016 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | EPB41-205 | ENST00000373797 | 2402 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PBX3-207 | ENST00000447726 | 2789 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CYB5R3-204 | ENST00000407332 | 1849 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CACNB3-203 | ENST00000540990 | 1814 nt | TSL 2 BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | KCNG3-201 | ENST00000306078 | 3824 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SEMA4B-202 | ENST00000411539 | 3807 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MANSC1-202 | ENST00000535902 | 5831 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | INA-201 | ENST00000369849 | 3231 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.9 | □□□□□ -0.34 | | |
| FOXE3 | Q13461 | DAB2IP-205 | ENST00000408936 | 6784 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 12.89 | □□□□□ -0.35 | | |
| FOXE3 | Q13461 | STK32C-204 | ENST00000368622 | 2010 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.89 | □□□□□ -0.35 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CCNA1-203 | ENST00000625767 | 1699 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.89 | □□□□□ -0.35 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RAD1-208 | ENST00000628399 | 1678 nt | TSL 3 BASIC | 12.89 | □□□□□ -0.35 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SERHL2-203 | ENST00000340239 | 1315 nt | TSL 5 BASIC | 12.89 | □□□□□ -0.35 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CTNNAL1-201 | ENST00000325551 | 2490 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.89 | □□□□□ -0.35 | | |
| FOXE3 | Q13461 | DUSP18-201 | ENST00000334679 | 2479 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.89 | □□□□□ -0.35 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PTEN-201 | ENST00000371953 | 9027 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.89 | □□□□□ -0.35 | | |