Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FOXE3Q13461 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FOXE3Q13461 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FOXE3Q13461 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FOXE3Q13461 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FOXE3Q13461 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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FOXE3Q13461 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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FOXE3Q13461 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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FOXE3Q13461 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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