Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms