Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SP140Q13342 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SP140Q13342 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SP140Q13342 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SP140Q13342 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SP140Q13342 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SP140Q13342 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SP140Q13342 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SP140Q13342 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SP140Q13342 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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