Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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CALCOCO2Q13137 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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CALCOCO2Q13137 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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CALCOCO2Q13137 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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CALCOCO2Q13137 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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CALCOCO2Q13137 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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CALCOCO2Q13137 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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CALCOCO2Q13137 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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