Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms