Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms