Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms