Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms