Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms