Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCLCP48506 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCLCP48506 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCLCP48506 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCLCP48506 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCLCP48506 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCLCP48506 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCLCP48506 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCLCP48506 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
GCLCP48506 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLCP48506 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLCP48506 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLCP48506 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLCP48506 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLCP48506 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms