Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms