Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNNB1P35222 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms