Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJB2P29033 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJB2P29033 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJB2P29033 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJB2P29033 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJB2P29033 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJB2P29033 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB2P29033 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB2P29033 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB2P29033 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB2P29033 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB2P29033 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB2P29033 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB2P29033 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB2P29033 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB2P29033 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB2P29033 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB2P29033 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB2P29033 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB2P29033 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB2P29033 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB2P29033 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB2P29033 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB2P29033 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB2P29033 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB2P29033 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB2P29033 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB2P29033 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJB2P29033 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms